除了上述“减容固化+深地质处置”方案，还有学者提出通过核反应使其嬗变成短寿命或稳定核素。这种方法的优点是耗时短、废物量小，但在实际情况中嬗变方法无法直接处理富含多种放射性核素的核废料，必须先将废水中的各种放射性核素进行有效分离，再有针对性地嬗变。
“但是，完全分离核废水中放射性核素是目前世界性难题之一。”晏敏皓说。
根据东京电力公司数据显示，其核废水中有63种放射性核素。日方采用“多核素去除装置（ALPS）”对废水进行处理，据2020年8月数据显示，处理后73%的核废水中仍含有超标的放射性元素，还需进行二次处理。
“可见‘多核素去除装置’并非一劳永逸，它无法将核废水处理至豁免水平。”晏敏皓指出。